Το Π.Μ.Σ. περιλαμβάνει υποχρεωτικά μαθήματα (Υ) και ΜΔΕ, απαιτεί δε τη συμπλήρωση 90 ECTS, όπως φαίνεται στον πίνακα που ακολουθεί. Η διδασκαλία γίνεται σε ένα τριήμερο (από Παρασκευή έως Κυριακή) κατά τη διάρκεια των 13 εβδομάδων του εκάστοτε εξαμήνου.
Το ενδεικτικό πρόγραμμα μαθημάτων ανά εξάμηνο διαμορφώνεται ως εξής:
Α΄ Εξάμηνο
| α/α | Κωδικός Μαθήματος | Μάθημα | Πιστωτικές μονάδες (ECTS) |
| 1 | MA01 | Φυσιολογία Αναπνευστικού Συστήματος | 5 |
| 2 | MA02 | Φυσιολογία Καρδιαγγειακού συστήματος | 5 |
| 3 | ΜΑ03 | Βιοδείκτες καρδιαγγειακής και αναπνευστικής ανεπάρκειας | 5 |
| 4 | MA04 | Εφαρμογές φαρμακολογίας στην καρδιαγγειακή και αναπνευστική ανεπάρκεια | 5 |
| 5 | MA05 | Mεθοδολογία έρευνας | 10 |
| Σύνολο | 30 |
Β΄ Εξάμηνο
| α/α | Κωδικός Μαθήματος | Μάθημα | Πιστωτικές μονάδες (ECTS) |
| 1 | MΒ01 | Εφαρμοσμένη Φυσιολογία – Παθοφυσιολογία νοσημάτων Αναπνευστικού Συστήματος – Case Studies | 10 |
| 2 | MΒ02 | Εφαρμοσμένη Φυσιολογία – Παθοφυσιολογία νοσημάτων Καρδιαγγειακού συστήματος – Case Studies | 10 |
| 3 | ΜΒ03 | Εφαρμοσμένη Φυσιολογία Μηχανικού Αερισμού | 5 |
| 4 | ΜΒ04 | Τεχνολογικές, μηχανικές και λειτουργικές υποστήριξης καρδιο-αναπνευστικής ανεπάρκειας | 5 |
| Σύνολο | 30 |
Γ΄ Εξάμηνο
| α/α | Κωδικός Μαθήματος | Μάθημα | Πιστωτικές μονάδες (ECTS) |
| 1 | ΜΓ01 | Διπλωματική εργασία | 30 |
Η κατανομή των μαθημάτων ανά εξάμηνο γίνεται με απόφαση της Συνέλευσης, σύμφωνα με τις ανάγκες του προγράμματος και τη διαθεσιμότητα των διδασκόντων και μπορεί να αποκλίνει από τον ανωτέρω ενδεικτικό πίνακα.